Научная школа-практикум «Технологии высокопроизводительных вычислений и компьютерного моделирования: вычислительные технологии для поддержки принятия решений» прошла в Петербурге с 12 по 15 апреля в рамках Всероссийского конгресса молодых ученых. Весенняя школа по высокопроизводительным вычислениям проводится в Северной столице уже в девятый раз, и в ее образовательную программу традиционно входят лекции и мастер-классы по обработке сверхбольших массивов данных и применению технологий компьютерного моделирования в различных предметных областях. Основной акцент в Весенней школе-2016 организаторы решили сделать на проектной работе участников: им предложили разбиться на группы, чтобы под руководством тьюторов из НИИ НКТ составить план решения какой-либо актуальной научной задачи и изложить его в виде заявки на участие в конкурсе грантов Российского фонда фундаментальных исследований.

Университет ИТМО. Весенняя школа по высокопроизводительным вычислениям
Университет ИТМО. Весенняя школа по высокопроизводительным вычислениям

«Современный ученый должен уметь не только решать научные задачи, но и обеспечивать себя и свою команду финансовой поддержкой со стороны соответствующих фондов. Для тренировки мы выбрали требования Российского фонда фундаментальных исследований, так как у РФФИ достаточно простая форма заявки на участие в конкурсе, не нужно заполнять массу сведений, связанных с технической стороной исследования, квалификацией коллектива, информацией об организации-исполнителе. При этом фонд выдвигает очень высокие требования к содержанию самой работы, которые соответствуют международным трендам развития научных направлений», — комментирует доцент кафедры высокопроизводительных вычислений Университета ИТМО и член программного комитета Весенней школы НИИ НКТ Алексей Духанов.

На финальной презентации в пятницу, 15 апреля, студенты Весенней школы представили на суд жюри шесть проектов. Три команды решили работать с урбанистическими проблемами — исследовать «геттоизацию» мегаполисов, экономику городов, которые целиком зависят от градообразующего предприятия, и изменения в городской среде при строительстве новых объектов. Другие взялись за прогнозирование распространения научных идей, определение опасности возникновения пробок после автомобильных аварий и поиск оптимального лечения на основе данных секвенирования геномов бактерий, вызвавших болезнь. Итогом некоторых исследований должно стать создание систем поддержки принятия решений — например, мобильного приложения, которое поможет сотрудникам дорожной полиции определять, какое из ДТП следует устранить в первую очередь.

Университет ИТМО. Весенняя школа по высокопроизводительным вычислениям
Университет ИТМО. Весенняя школа по высокопроизводительным вычислениям

«Каждой команде мы предложили помочь подготовить заявку, которую действительно можно будет отправить на конкурс РФФИ, — мы будем рады, если фонд поддержит эти исследования, однако для нас и для участников весенней сессии будет полезен любой полученный опыт, — отмечает Алексей Духанов. — В современной науке крайне тяжело работать в одиночку, а в будущем это станет невозможным, потому что исследования сейчас все больше приобретают междисциплинарную природу. Поэтому мы стараемся посвящать наши мероприятия наращиванию командных навыков и учим студентов быть гибкими и уметь быстро адаптироваться к изменяющимся условиям».

Отметим, что исследование данных NGS-секвенирования было признано лучшим среди проектов девятой сессии Школы НИИ НКТ. Проект основывается на работе выпускника Санкт-Петербургской химико-фармацевтической академии Ярослава Баранова, который в 2013 году стал одним из победителей программы «УМНИК» по направлению «Медицина будущего». Он рассказывает, что в некоторых случаях болезнетворные бактерии невосприимчивы к медикаментам: лечение не помогает, и пациенту становится только хуже. Избежать таких ситуаций помогут данные, полученные из генома бактерии.

Университет ИТМО. Ярослав Баранов
Университет ИТМО. Ярослав Баранов

«В геноме можно найти последовательности, которые расскажут о характере резистентности к тем или иным лекарствам, и эта информация должна определять дальнейшую терапию. В качестве примера мы выбрали возбудитель туберкулеза — палочку Коха, — объясняет Ярослав Баранов. — Лично я сейчас планирую проработать академическую часть исследования, а также выяснить, где оно найдет больший отклик — в научной среде или в индустрии».

Добавим, что участников Весенней школы НИИ НКТ пригласили на всероссийский конкурс прорывных проектов в области информационных технологий «IT-прорыв», общий призовой фонд которого составляет 2 миллиона рублей. Полуфинал регионального этапа конкурса состоится 23 апреля.