Результаты поиска по тегу «Биоинформатика» 44 результата
Ученые создали алгоритм для изучения эволюционной истории видов с полногеномными дупликациями
Международная группа ученых создала компьютерный алгоритм для изучения эволюционной истории живых организмов с дуплицированным геномом, главным образом дрожжей и растений. Программа позволяет проанализировать генетическую информацию о подобных видах и сделать вывод о том, как у них произошла полногеномная дупликация и почему она закрепилась в ходе эволюции. Статья опубликована в журнале Oxford Bioinformatics, одном из лидирующих научных изданий по направлению Computer Science.
27.02.2020
Биоинформатик Алексей Комиссаров: Мы хотим, чтобы можно было ткнуть в любой участок генома и уверенно сказать, за что он отвечает
Недавно команда Международного научного центра SCAMT Университета ИТМО пополнилась биоинформатиком Алексеем Комиссаровым, который занимается сборкой и аннотацией сложных геномов животных и людей. В конце 2019 года исследовательская группа «Прикладная геномика», которую он возглавляет, получила грант РФФИ. Их проект будет посвящен анализу геномов куньих, живущих на территории России. Также исследователь работает над изучением генов и белков в нервных клетках миног, что может помочь в борьбе с нейродегенеративными заболеваниями. Корреспондент ITMO.NEWS пообщался с ученым и попросил рассказать подробнее о его самых перспективных исследованиях.
27.01.2020
Геном в «цифре»: как IT-технологии применяются в генетике и медицине
Доцент факультета информационных технологий и программирования Университета ИТМО, руководитель Международной лаборатории «Компьютерные технологии» Владимир Ульянцев провел лекцию «Биоинформатика: как геномные данные помогают изучать происхождение людей и механизмы развития заболеваний» в павильоне Новой Голландии. Несколько десятков горожан пришли, чтобы узнать, как сегодня ученые получают геномную информацию, какую роль в этом процессе играют программисты и где применяются полученные результаты. Основные тезисы лекции в материале ИТМО.NEWS.
02.09.2019
Исследователь из Университета ИТМО Константин Зайцев вошел в пятерку лучших молодых ученых в России по системной биологии
Сотрудник международной лаборатории «Компьютерные технологии» Университета ИТМО Константин Зайцев стал победителем программы Skoltech Fellowship Program 2019 и вошел в пятерку лучших молодых ученых в России по системной биологии. Торжественная церемония награждения состоялась накануне в Москве. В последние несколько лет молодой ученый занимается разработкой методов анализа данных активности генов, которые позволяют находить транскрипционные маркеры клеточных типов, находящихся внутри смешанных образцов. О своей работе и исследовании в Nature Communications, о том, как стать системным биологом и почему этой областью можно сегодня успешно заниматься и в России, Константин Зайцев рассказал в интервью ITMO.NEWS. А также на примере пачки Skittles он наглядно объяснил, зачем ученым необходимо секвенировать РНК одиночных клеток.
31.05.2019
Магистрант из Индии Мринал Вашисх: «Овладевая несколькими профессиональными областями, ты становишься супергероем»
Мринал Вашисх приехал обучаться на магистерскую программу «Биоинформатика и системная биология» Университета ИТМО из Раджастхана, Индия. В прошлом Мринал работал в одном из крупнейших научно-исследовательских институтов Индии, а в будущем планирует погрузиться в изучение нейронаук и исследовать механизмы работы памяти и языка. ITMO.NEWS поговорил со студентом о том, чем хорош современный междисциплинарный подход в обучении и в чем сила данных.
17.05.2019
На пересечении научных направлений: специалист по биоинформатике Никита Алексеев – о проблемах отрасли и работе в Университете ИТМО
Ведущий научный сотрудник факультет информационных технологий и программирования, участник программы ITMO Fellowship Никита Алексеев вернулся в Санкт-Петербург после нескольких лет работы в области биоинформатики в США. В интервью он поделился своим взглядом на биоинформатику и рассказал о своей карьере.
02.05.2019
Мастер спорта Анастасия Мурзина: «Спортивное ориентирование помогает мне лучше понять многомерное пространство»
Нередко любимое хобби или занятия спортом помогают в решении научных задач. Например, широко известно, что Эйнштейн нередко прибегал к музыке, когда обдумывал ту или иную идею. Магистрант Университета ИТМО Анастасия Мурзина занимается хемоинформатикой и уже больше года работает над проектом в лаборатории «Компьютерные технологии». А в свободное от науки время она успела объездить почти пол-России и получить мастера спорта по спортивному ориентированию, которым занимается с шести лет. Мы поговорили с Анастасией о том, как спортивное ориентирование помогает ей в научных задачах, что необходимо знать программисту и почему между спортом и наукой больше общего, чем кажется.
18.09.2018
Таргетированное лечение рака и восстановление «филогенетического дерева» – какими исследованиями в области рака занимались молодые специалисты в рамках Летней школы по биоинформатике
Биоинформатика в исследованиях рака – активно развивающаяся область науки. Сегодня с ее помощью можно выявлять среди большого количества данных не только изменения генома, которые способствуют возникновению разных типов рака, но и факторы, которые ускоряют или замедляют этот процесс. Вопросам исследования рака была посвящена крупнейшая Летняя школа по биоинформатике 2018, которая прошла в пригороде Санкт-Петербурга. В рамках школы молодые ученые работали над проектами, посвященными анализу клинических данных рака молочной железы, построению «филогенетических деревьев» в раковых данных, анализу дифференциальной экспрессии длинных некодирующих РНК (lncRNA) в почечно-клеточном раке (kidney renal cell carcinoma) и другими. Участники школы рассказали ITMO.NEWS о проектах и актуальных исследованиях по биоинформатике в области исследования рака.
30.08.2018
Фестиваль «Кампус»: можно ли заниматься Computer Science в России — рассказывает доцент Университета ИТМО Владимир Ульянцев
Зачем программистам изучать Computer Science? Чем занимаются ученые лаборатории компьютерных технологий? И как начать научную карьеру тем, кто не хочет просто писать код? О Computer Science в России, работе на стыке наук и о том, как программистам начать заниматься серьезными научными исследованиями, на фестивале «Кампус» рассказал руководитель международной лаборатории «Компьютерные технологии», доцент Университета ИТМО Владимир Ульянцев. Провел открытое интервью Вячеслав Шебанов, руководитель команды сообщений «ВКонтакте». ITMO.NEWS записал главное.
04.07.2018
BioHack-2018: как за 48 часов составить картотеку песен дрозофил и кому это нужно
В Санкт-Петербурге состоялся 48-часовой хакатон BioHack. Сборные команды биологов и программистов из нескольких городов России решали научные и прикладные задачи в области биоинформатики. На мероприятии собрались как студенты, так и начинающие ученые. Хакатон проводился при поддержке компании-разработчика цифровых платформ EPAM и Института биоинформатики.
07.03.2018