Оценка Nature Index проводится по двум основным критериям. Всех участников рейтинга располагают в топе по article count (общее число статей) и fractional count, основанном на доле статей, опубликованных в 82 престижных научных журналах, отобранных независимой группой ученых и отслеживаемых базой данных Nature Index.
 
Составители рейтинга подчеркивают, что все участники рейтинга отличаются друг от друга и показатель fractional count не может учесть все особенности той или иной научной организации. Также они уточняют, что существует множество причин, по которым результаты рейтинга могут сильно варьироваться из года в год, но подчеркивают ценность рейтинга как сборника самых лучших и востребованных научных статей по естественным наукам за прошедший год.
 
В общем рейтинге стран Россия занимает 18-ое место по публикационной активности. В десятке сильнейших организаций, занимающихся научными исследованиями, три научных центра (РАН, НИЦ «Курчатовский институт», Объединенный институт ядерных исследований) и семь вузов (МГУ им. Ломоносова, СПбГУ, МФТИ, Университет ИТМО, Сколтех, Казанский федеральный университет, МИСиС). Четыре вуза-участника Проекта 5-100 входят в ТОП-10 Nature Index.
 
 
Университет ИТМО за 2018 год, по данным Nature Index, опубликовал 61 статью (article count), релевантную отбору рейтинга. Fractional count всех публикаций составил 15, 41. Больше всего статей опубликовано по физическим наукам (Physical Sciences) – 53, химии (Chemistry) – 18, наукам о жизни (Life Science) – 4. Добавим, что некоторые статьи могут относиться сразу к нескольким категориям. Больше информации о результатах вуза – по ссылке.